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不相关基因同源的连续核苷酸不

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发表于 2023-7-30 19:47:38 | 显示全部楼层 |阅读模式
Bashir 和合作者提出的指南 [ 30]对结果进行手动评估] 鉴定最有可能抑制 RVFV N mRNA 表达的 siRNA。在设计和插入我们的查询时,我们热衷于仅使用ORF候选物,没有SNP,避免任何超过四个的核苷酸的内部重复,以及任何刺激免疫反应的基序。来自所有这些不同软件的序列根据得分、该序列在许多不同软件中的出现情况、siRNA满足的指导方针的数量来排列。BLAST 工具用于拒绝与不同数据库的任何序列同源性,因为与任何超过 15 个。前三名 siRNA 是针对 N mRNA 上的 3 个不同位点开发的,阻断 RVFV 表达的可能性最高(表 1 ))通过针

对病毒基因组中最保守的区域,任何突变都可能导致偏差[ 14 ]。偶然的是,D1 siRNA 是亚洲手机号码列表之前设计并报道过的[ 21 ]。 表1 siRNA靶向核蛋白的序列 全尺寸桌子 siRNA 设计的处理 siRNA 以冻干的 10 nmol 形式提供,根据制造商说明在 siRNA 缓冲液中重构,在 20 µM 储备溶液中等分,并储存在 -20°C 直至进一步使用。在每个实验中应用TOX siRNA (siTOX) (DharmaconTM RNAi Technologies, Lafayette, USA)来确定转染效率和细胞中的siRN


A摄取。使用先前工作 [ 21 ]中的荧光素酶 siRNA 序列作为阴性对照。阴性对照由(DharmaconTM RNAi Technologies,Lafayette,美国)生成并提供,以识别用各种 siRNA 处理的细胞中的任何变化,并比较特异性和非特异性 siRNA 效果。所有设计中都使用了两个 UU 突出端,以提高 siRNA 对 RNase 的稳定性 [ 10],提高可重复性,即使在低剂量下也能产生持久的效果。 使用台盼蓝排除法测定转染效率 通过在相同的实验条件下用 200 nM siTOX(Dharmacon RNAi Technologies,Lafayette,



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